O MARE é um centro de investigação científica, desenvolvimento tecnológico e inovação, orientado para os problemas e desafios da sociedade. Com competências técnicas e científicas para abordar todos os ecossistemas aquáticos, incluindo bacias hidrográficas e áreas adjacentes, estuários, ecossistemas marinhos costeiros e oceânicos, o MARE adopta uma abordagem integradora e holística, em estreita parceria com instituições nacionais e internacionais. Está localizado em oito Unidades Regionais de Investigação, em campus do ensino superior em Portugal continental, respetivamente Universidade de Coimbra (MARE-UCoimbra), Politécnico de Leiria (MARE-PLeiria), Universidade de Lisboa (MARE-ULisboa), Universidade NOVA de Lisboa (MARE-NOVA), ISPA (MARE-ISPA), Instituto Politécnico de Setúbal (MARE-IPSetúbal), Universidade de Évora (MARE-UÉvora), e ARDITI/Universidade da Madeira (MARE-Madeira).